Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho.
Parceiros
O WOMBAT é um programa para facilitar as análises que se ajustam a um modelo linear e misto via REML (verossimilhança máxima restrita).
Para este exemplo estaremos utilizando uma configuração de execução em thread única, dessa forma, é recomendado que o arquivo .srm tenha os seguintes parâmetros para a submissão do job:
#!/bin/bash
#SBATCH -J wombat # Nome do job
#SBATCH -p medium # Fila (medium/long/gpu)
#SBATCH -n 1 # Numero de processos MPI (threads)
cd $SLURM_SUBMIT_DIR # Diretório do qual o sbatch foi chamado
cd A # Diretório onde está o exemplo
echo "-----------------------------------------"
ulimit -s unlimited
ulimit -a
echo "-----------------------------------------"
echo $SLURM_SUBMIT_DIR
srun wombat
echo "-----------------------------------------"
date
De acordo com o exemplo acima, o wombat deve ser executado dentro do diretório onde encontra-se os arquivos para análise, diretório A nesse caso.
Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho.